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从计划体制到双轨体制
我国煤炭价格形成机制按照时间顺序大体分为二个阶段。
在第一个阶段（建国到1985年前后），国家制定煤炭价格，实行价格单轨制。建国初期，在我国产品定价理论和实践中，流行着苏联的一种观点和主张，即重工业中创造的纯收入的一部分，应在轻工业和其他生产用品的部门实现，主张对生产资料采取低价政策。当时全国刚刚解放，又加上抗美援朝，百废待兴，国家为保证市场稳定，采用了煤炭低价政策。随着经济的发展，煤矿开采规模和机械化水平的提高，职工劳动保护条件和待遇的改善，以及资源条件的变化，煤炭生产成本相应增加，全行业出现亏损，迫切需要调整提高煤炭价格。但由于煤价“牵一发而动全身”，国家对煤炭价格调整采取了慎之又慎的态度。这期间国家五次调整煤价，都是微调。一直没有从根本上考虑煤炭价值补偿和市场决定价格问题。结果是经过调价价格失衡问题有所缓解，但很快出现价格复归和出现更大的价格矛盾。
第二个阶段（1985年前后至今）国家控制大部分煤价，实行价格双轨制。从1985年前后，国家一方面支持小煤矿发展，小煤矿价格开始随行就市；另一方面对国有煤矿进行总承包，允许煤矿超产煤和超能力煤加价，开始对煤炭价格实行松动政策。
1993年以后国家逐步放开煤价，到2002年决定全部放开电煤价格，历时10年。这一时期电煤仍然执行的是政府指导价，煤炭价格实际上放而未开。即使是政府决定全部放开电煤价格后，重点合同电煤价格与市场煤价格的差距仍非常大，当年全国电煤平均价格比市场煤低40-70元。
今年以来，全国煤电油运继续全面紧张，6月中旬国务院针对煤炭供需形势决定，“电价调整后，电煤价格不分重点合同内外，均由供需双方协商确定”，表明了政府彻底放开电煤价格的决心。但由于历史的惯性、部分地方政府的干预和发电企业集中采购的优势，目前真正意义上的相互协商确定煤炭价格的机制并未形成，电煤与市场煤价格、计划内与计划外、省内与省外三种价格差距依然较大。截止到9月末，国有大型煤炭企业（原中央财政煤炭企业）电煤平均价格155．59元/吨，比当期商品煤平均售价198．54元低了42．95元。
此外，由于煤炭经济结构不合理，行业内无序竞争严重。目前我国2．8万多个煤矿，规模以上的煤炭企业3400多家，经营过度分散，无序竞争严重，煤炭供大于求时相互竞相压价，市场秩序混乱，价格大幅度下滑，行业经济发展陷于十分困难境地。
成本核算框架计划色彩浓厚
濮洪九指出，多年形成的煤炭成本核算框架不科学，使成本不能真实全面地反映煤炭在生产过程中的实际耗费。目前我国煤炭行业成本核算框架，仍带有浓厚计划经济色彩。其主要表现是煤炭成本核算项目不完整，成本项目核算系数规定的过死。
一是煤炭成本和价格不反映资源成本。开办煤矿必须有可靠资源，因此建矿前必须对资源进行一系列的普查、详查和精查。计划经济时期国家包揽了煤炭所有的地质勘查工作，煤矿只要在指定的地点建井就行了。市场经济以后，企业新建矿井不仅需要出资取得探矿权、购买采矿权，并且还需要依靠自己投资对资源进行进一步精查，才能进行矿井设计和施工。这些获取资源支出和勘查前期费用需要通过成本核算进行补偿。因此，在煤炭价格构成中，首先必须包括资源补偿费（矿权）。这部分价格构成在整个价格中的比重大小，取决于煤炭资源的有限性和替代能源的生产成本等各种因素。
二是煤炭成本和价格中不反映煤矿退出成本和费用。煤炭是不可再生的资源，所有的煤矿都会因资源枯竭而关闭退出。煤矿关闭前，企业需要大量资金用于转产和人员安置，而这些费用目前企业不能预先提取计入成本，所需资金没有来源。前几年，国家不得不动用大量财力，对资源枯竭和扭亏无望的原国有重点煤矿进行政策性破产。今后随着市场经济体制的不断完善，这项政策将逐步淡出，煤炭企业必须积累这部分退出转产资金。同时煤炭企业要继续生存，必须建设新的矿井，开发新的接续资源，需要大量投入，同样这些费用必须在成本中得到补偿，包含在煤炭价格中。而在现行核算框架下，这些费用不能预提，不能计入成本项目，所需资金没有来源。
三是煤炭成本核算项目系数规定的过死。按照市场经济要求，生产过程的投入是企业自主经营的基本内容。煤矿开采条件差异较大，不同企业所采用的开采技术、设备和人员投入不同，从而导致不同企业的煤炭产品成本也不尽相同。但实践中，煤矿固定资产折旧、维简费和沉陷治理费用提取标准是国家统一规定的。尽管在规定中也考虑了不同矿井开采条件的差异性，分类别地制定了标准，但与实际需要仍有较大差距。如，淮南煤矿多是超级瓦斯矿井，防治瓦斯支出大，估算吨煤投入大约在10元左右，而过去规定煤矿瓦斯治理费只有1元，大大低于实际需要。再如，现行煤矿采煤沉陷资金提取标准过低，根本满足不了需要，欠账越积越多，沉陷区房屋建筑搬迁问题越来越多，引发了一些严重的社会问题，国家不得不拿出大量资金补还欠账。
濮洪九说，正是大量煤炭成本外部化，成本核算不真实，才引发了目前煤炭涨价过快、煤炭企业利润过高的议论。
