近年来我国纺织和服装加工能力得到进一步扩张，对棉花的需求出现明显增长，2005年国内棉花缺口约370万吨左右，同比扩大140万吨，导致棉花进口大幅增长。而张家港保税区位于棉纺业较发达的长三角，距离江苏省五大纺织出口城市南京、苏州、无锡、常州和南通近，运输成本低廉，水陆交通便利，港口优势突出，具有独特的保税仓储、分拨功能，不仅利于货物的快速集散，而且更适合棉花大规模存放小批量分拨业务的开展，为棉花进口商提供了大量商机。同时，由于目前国内外的棉花存在较大的差价，刺激了棉商的进口欲望，又由于纺织企业2005年度棉花进口配额已用完，因此棉商纷纷把进口棉花放进保税区进行仓储，以等待2006年度棉花进口配额下发。据海关统计，2005年1-12月份，张家港保税区共从国外进区棉花2.89万吨，价值3825万美元，同比分别增长47%和18%。主要进口自主要自澳大利亚、贝宁、印度、马里、美国、乌兹别克斯坦、墨西哥、乍得等国。

    作为张家港保税区的主管部门，保税区海关以“监管最有效、手续最简便、服务最满意”为目标，不断调整工作思路，采取电子手册、无纸化报关、物流信息化管理等卓有成效的措施，大幅提高棉花进口的通关效率，特别是对进库棉花利用闭路电视监控系统进行远程监控，通过这一方法，既解决了棉花仓储企业要求货物及时通关的问题，又达到了有效监控进口棉花入库的目的。

    随着张家港保税区区港联动试点工作的不断深入，现已有越来越多的大型棉花物流仓储企业落户张家港保税区。其中，仓储面积达4万平方米的骏达物流公司将其在天津长期开展的棉花仓储业务转移至张家港保税区，目前已正式投入运营。作为中国纺织业龙头之一的中国华芳集团，已把张家港保税区作为其进口棉花仓储、分拨基地，去年中国华芳集团共进张家港保税区棉花达2.2万吨，占总量的76.1%。由于有周边巨大的消费市场，目前，张家港已成为我国棉花主要的进口口岸。以市场作为物流的一种重要载体，张家港保税区的棉花集散中心带动了保税区及其腹地物流业的快速发展，同时也带动了上下游产业的发展，形成了产业聚集效应，对区域经济的持续快速发展发挥了重要的推动作用。为更好地帮助张家港保税区做大做强棉花物流产业，张家港保税区海关鉴于保税区内新建棉花仓储企业比较多的特点，主动走访企业送政策上门，对企业有关人员进行海关法规、通关程序以及物流信息系统程序的培训，指导棉花仓储企业迅速走上正轨，受到了企业的广泛好评。