据云南信息报报道，新三板正在酝酿多项制度创新，其中既包括已经讨论多时的做市商制度，也有新近列入议程的股票质押融资业务。由于新三板实行严格的投资者准入制度，对风险的包容度更大，其各项创新比如优先股、股债结合的混合融资产品等也有望走到主板和创业板市场前面。
据知情人士透露，按照新三板交易所方面的计划，今年内将同时实现试点范围扩大和引入做市商制度，但并没有最终确定时间表。
新三板交易所方面曾多次组织券商研讨做市商制度。按照目前确定的基本框架，在做市商制度下，证券公司将先期买入标的公司股票作为未来提供做市服务的存量股票。这也意味着做市业务将消耗证券公司的资本金，证监会和证券业协会需要为此制定相应的净资本扣减比例。
在股票质押融资方面，新三板交易所方面希望更进一步，推动代办券商参与到此项业务中来。即新三板企业的大股东或实际控制人将持有的公司股票质押给券商，从券商融入资金用于对公司追加投资，或者也可以用作其他用途。
券商参与的新三板股票质押业务相比银行有一定优势。一方面，代办券商作为推荐企业挂牌的中介机构，熟悉企业情况，更容易辨识融资风险；另一方面，在新三板交易所、登记结算公司以及监管机构的共同参与下，股票质押与回购的流程将更清晰，从而提高效率、降低风险。
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