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财务管理在风险投资中的重要性是不言而喻的，他包括风险投资机构本身及对所投项目企业进行财务管理。在这一过程中，对人的管理，对制度的设计，是最基础的工作，也是最重要的工作环节。
在财务管理具体实践中，实行纵横交叉的网络式管理，可以既保证对投资企业的动态全面了解，又重点掌控一些核心企业。在管理方式上有这样几种方式可以借鉴：
1、财务经理双任联签制
这项制度对投资企业的各项资金运转由公司派驻的财务经理与项目方的财务经理实行联签，对企业的经济活动进行动态跟踪管理，确保公司的经济利益。相对比较成熟，有自己比较独立和完善的财务会计体系的公司比较适合采用这种模式。
2、财务经理单任制
财务经理单任制即由公司派出唯一的财务经理，负责管理投资企业的各项财务活动。优点是控制比较严密，管理风险小，缺点是一个企业一个财务经理，管理成本高。
3、代理记帐制
对一些比较小型的创投项目，作为公司财务管理的延伸，可采取代理记帐的方式，以相应降低管理成本。
4、中介机构审计的方式
还有部分项目是根据公司的需求，采取聘请受信任的中介机构审计的方式进行管理。
5、数据库管理方式
用投资管理信息系统的方式进行横向动态管理，也就是利用公司正在建立的数据库实现对公司已投资项目财务状况的动态了解和掌握，从数据库设计的财务功能来看，共有三级财务数据系统，一是大量的基础财务数据，这是对企业经营状况分析判断的基础，二是在此之上系统自动生成的各种比率分析数据，通过对各种比率的分析了解，可以掌握企业的动态财务状况及趋势，三是在一、二级数据的基础上设计的预警系统，比如，发现企业的现金保有量不足三个月的消耗量等情况，系统会自动预警。通过数据库这种规范、标准的动态反映，可以满足公司各类人员在项目管理方面的需求。
风险投资做为知识经济社会中技术创新与金融创新相结合而生成的一种新型事物，其能否成功在很大程度上取决于对人的管理。对于老板来说，如果任用的财务管理人员不适当，就无法满足公司对投资企业的财务管理需要。如何管理财务人员呢？
首先应实行定期汇报制度。风险公司的外派财务经理通常每天工作在投资企业，财务部门每月召开一至两次部务会议，专门汇报交流投资企业的财务情况及管理心得，其中重要的财务信息汇成文件上报公司领导及相关业务部门，以利于公司对投资企业的管理。
此外，要对其实行定期培训制度。风险投资公司的财务管理有别于一般的财务管理，它要求较高的财务前瞻性及较综合的财务管理能力。随着市场经济体制的不断完善，会计核算和财务管理发生了重大的变革。为尽快跟上这种变化，公司财务部门需要不断地培训。定期培训制度一是适应会计制度的变革，随时更新自己的知识结构，二是向国际惯例靠拢，加强对国际会计准则的了解，以适应国际化的步伐，三是加强对科技动态与财会专业的发展等相关业务的了解，比如，已进行过包括新旧会计制度的对比、企业价值评价、内资企业与合资企业税收政策的比较、网络与会计、我国会计准则与国际会计准则异同系列专题培训。
