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根据《意见》，此次创新基地建设目标为，一是要通过整合农业科教环能资源，积极推动农业科技体制机制创新，加强农业科技创新、技术集成示范、技术推广服务、新型职业农民培育等工作的统筹衔接，逐步实现“发现问题-研究问题-集成应用-解决问题-发现新问题”的螺旋式上升科研路径，促进科研、教育、推广一体化协同发展。
二是以区域主导产业和农村经济发展实际需求为导向，逐步将创新基地建设成为科技支撑能力强、农业经营形态先进、不同产业之间有机衔接、可持续发展特点突出的现代农业先导区和示范区。力争到“十三五”末，把创新基地建成科学研究试验田、技术示范样板田、职业农民观摩田、生态农业模式田和农业决策参考田。
《意见》要求，切实抓好创新基地重点建设任务。创新基地无论在科研还是推广服务层面，都要加强与农业企业、专业合作社、家庭农场、社会化服务组织等农业技术应用主体的联合协作，建立良好的技术需求征集和研发成果反馈机制。此外，要将新型职业农民培育工作纳入系统规划，将农民的科技需求与创新基地的科研和推广计划进行有机结合，以实效为目的，探索建立新型职业农民培育机制。
《意见》强调，建立以“政府+基地+专家（农技员）+企业（新型经营主体）+农民”模式为主的农技推广服务机制。要切实将农民需要的技术在创新基地进行熟化、集成和试验示范，由科技专家或基层农技员推广到企业、专业合作社、家庭农场等新型经营主体，进而辐射到广大普通农民。农业部和地方农业部门要在创新基地建设政策上给予更多支持，积极吸引金融信贷、风险投资等社会资金投入创新基地建设。
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